タンパク質構造予測とは
タンパク質構造予測（Protein Structure Prediction）とは、アミノ酸配列からタンパク質の立体構造をAIで予測する技術です。DeepMindのAlphaFold2が2020年にこの50年来の難問を実質的に解決し、構造生物学・創薬・生命科学に革命的なインパクトをもたらしました。
AlphaFold2の画期的成果
AlphaFold2は2020年のCASP14コンペティションで、実験的に決定された構造とほぼ同等の精度でタンパク質の三次元構造を予測し、他の参加チームを圧倒しました。その後、2億を超えるタンパク質の構造予測結果がデータベースとして無料公開されています。
創薬への応用
タンパク質構造の予測は、薬物設計のターゲット分子の立体構造理解に不可欠です。AlphaFoldの成果により、構造ベースの創薬（SBDD）が大幅に加速し、新薬開発の期間とコストの削減に貢献しています。
AlphaFold3とその先
2024年に発表されたAlphaFold3は、タンパク質とDNA、RNA、小分子などの複合体構造の予測に対応し、より実用的な生物学的相互作用のモデル化を可能にしました。この研究は2024年のノーベル化学賞受賞につながりました。